希波克拉底斯(Hippocrates, 西元前460-370)在古老的年代，就說出了非常有智慧的見地：「所有疾病都始於腸道」。
我們的腸胃道中，佈滿微生物菌群，主要有三種：
1. 必要有有益菌群：主要是雙歧桿菌屬、乳酸桿菌、丙酸桿菌、大腸桿菌的生理菌株、消化鏈球菌、腸球菌等等。
2. 伺機性的菌群：包括，類桿菌屬、消化球菌屬、葡萄球菌屬、桿菌、梭狀芽孢桿菌屬、酵母菌、腸內細菌科細菌(變形桿菌屬、克雷伯氏菌屬、檸檬酸菌屬)、細梭菌屬、真細箘、鍊狀細菌，和其他種類。
3. 過渡菌群：每天吃進去的微生物，通常是葡萄糖非發酵菌。
人類腸胃道中微生物的種類眾多，目前已知的就有500多種。但是由於它們之間的關係複雜，我們對這個生態系的了解尚且有限。
基本的概念是，各種菌群之間，如果能夠保持一定微妙的的平衡，人就會呈現健康的狀況，訊息透過腸–腦的軸線傳輸，人就會感到神清氣爽。
而如果這種平衡改變了，經常是必要益菌群受到了壓抑，那麼就會促使伺機性的菌群，甚至過渡性的菌群過度的增生，產生毒素，對人體造成危害。
菌群生態可能受到諸多因素的影響：抗生素藥物、含有抗生素的食物、止痛藥、類固醇藥物、避孕藥、加工食品尤其是碳水化合物、長期斷食/飢餓/暴食、傳染病、壓力、體力消耗、年老、酗酒、污染、接觸有毒物質、季節因素、暴露在游離輻射之下、極端氣候。
這些因素，如果可以，要儘量避免。
伺機性的菌群在缺乏有益菌群的抑制而增生，會大幅增加它們產生的毒素，其中之一是胺基酸代謝物的胺類，譬如組織胺，本來有其生理功能，但是在伺機性的菌群大量製造之下，就會造成過敏、低血壓、多唾液、下視丘調節荷爾蒙的功能產生障礙、情緒不穩、睡眠異常、上癮等症狀。這種高組織胺的狀態，在憂鬱症患者、感覺失調症、上癮者和自閉症的人身上都有發現。這是一個腸胃菌群失衡，會影響健康的例子。
有一種類桿菌屬的伺機菌，最愛吃糖、澱粉和乳糖。它們是念珠菌的好朋友，經常被發現在感梁發炎的地方。這也充分說明，西方嗜糖的飲食習慣，對身體所帶來的壓力。
伺機菌中的梭狀芽孢菌屬，總是在自閉症患者的糞便中被發現。
健康的腸胃道的腸壁，沒有足夠的益菌群保護，伺機菌所產生的毒素就會跑到血液裏去。
破傷風桿菌是梭狀芽孢桿菌的一種，它產生的毒素本來是無法穿過健康的腸壁的，可是一旦腸壁缺乏足夠益菌的保護，就另當別論了。
對光和噪音敏感，是破傷風感染，也是自閉症、思覺失調症、精神病、失讀症患者典型的症狀呢！
腸壁上的絨毛細胞，沿著絨毛從底部隨著成熟的過程逐漸往外往上挪，幫忙吸收營養，最後死亡時排出體外。但是，一旦益菌群的保護弱化了，也會影響到絨毛細胞吸收營養的能力。
醫生喜歡給病人投以廣效型的抗生素，以求速效，結果造成益菌群大幅被順帶殺死，提供給可以抵抗抗生素的伺機菌，譬如梭狀芽孢桿菌群，瘋狂生長的機會。
在腸道生態失調之下，硫酸還原菌也可能不正常增生，這些微生物，將食物中的硫酸鹽代謝為亞硫酸鹽，其中有許多具有毒性。而自閉症的患者，有95%有嚴重缺乏硫酸鹽的狀況。
在失調的腸道，麩質和酪蛋白將無法被完全消化，而會產生類似鴉片、嗎啡、海洛因之類的物質。思覺失調症、注意力不足過動症、產後精神病、癲癇、唐氏症、憂鬱症和一些自體免疫問題(類風濕性關節炎)的患者，在尿液中都驗出了麩質嗎啡和酪蛋白嗎啡。
沒有益菌保護的的腸細胞，可能會缺乏雙胜肽水解酶，無法把麩質嗎啡和酪蛋白嗎啡變成更小的胜肽，麩質嗎啡和酪蛋白嗎啡穿過受損的腸壁，經血液影響到了大腦，身心因為充滿大量的胜肽殘骸而受到了影響。
愛爾蘭人在1845年發生馬鈴薯荒，開始採用小麥作為主食，結果開始有思覺失調症或乳糜瀉的患者，後來愛爾蘭居多成為那些疾病最高發病率的國家之一。
初生嬰兒的腸胃道是沒有微生物的，在產程中經過陰道擠壓的過程，繼承了母親的菌群。而接下來透過母乳的吸吮及親密的肌膚接觸，繼續完成菌群的建立。這也是為什麼母親最好自然產，而且一定要儘量餵食母乳的原因。
然而，如果母親本身本來的菌群已經失衡了，那麼嬰兒從母親接收到的菌相，也是失衡的喔！而且，母親腸胃道微生物所產生的毒素，會透過胎盤，進入胎兒的身體。準媽媽，要格外注意自己身體的健康，提早慎選食物，是傳統的智慧。
目前，我們對腸胃道中的菌群及它們之間的互動關係，了解還是很少。要促進腸胃道建立及維持健康的菌群，沒有特別有效的簡單方法。
You are what you eat. 要儘量吃原始自然的食物，不要吃加工食品，減少糖的攝取，飲食要均衡，加強饍食纖維，慎用抗生素，是幾個重要的原則。
我們的腸胃道和其中的菌群，是我們的第二個腦。只有擁有健康的腸胃道菌群，我們才能真正頭好壯壯。
*：《改善情緒障礙的腸道食療聖經》，娜塔莎·坎貝爾·麥克布萊德 著，陳莉淋 譯
2020/12/7 第二個腦 Damakey
